В ответ на запрос "Выберите объекты" после выбора объектов введите и (Исключить).
Введите любую опцию выбора, например, мн-секрамка (Секущая рамка многоугольника) или л (Линия) и выберите объекты, подлежащие удалению из набора объектов.
Для возврата к операции добавления объектов введите д (Добавить).